TUTORIAL DE BÚSQUEDA BIBLIOGRÁFICA

¿Cómo realizar una búsqueda bibliográfica?
¿A que otras bases de datos puedo acceder desde internet?
¿Qué es medline?
¿Cuál es su utilidad para los médicos?
¿Cómo puedo acceder a medline?
¿Cómo realizar una búsqueda de medline?
¿Qué es un término MESH?
Usando pubmed
Cómo realizar una búsqueda de medline por e-mail?
Estrategia de búsqueda en medline
Bibliografía

BÚSQUEDA BIBLIOGRÁFICA

Las búsquedas bibiográficas en la actualidad son más fáciles de realizar, por ejemplo desde nuestra casa, y su resultado es más completo gracias a la introducción de las citas bibliográficas en bases de datos. Estas bases de datos son rápidamente exploradas por poderosos motores de búsqueda de las computadoras a partir de los datos que nosotros le indicamos. 
Algunas bases de datos se encuentran disponibles en forma gratuita y otras a través del pago de una cuota anual. De todas las bases de datos de referencias bibliográficas en biomedicina, MEDLINE es la más completa y compleja y está disponible en forma gratuita a través de internet o del correo electrónico.
No considere por completa a una búsqueda bibliográfica realizada solamente en MEDLINE dado que existe un listado muy grande de bases de datos, el inconveniente es que muchas citas se encuentran en más de una de ellas, por lo tanto al realizar la búsqueda en varias nos encontramos con artículos repetidos.
Actualmente se están publicando libros de texto en formato digital en internet y muchos de sus capítulos se encuentran ligados por links a las citas de revistas de publicación periódica. También algunas asociaciones médicas publican consensos, guías clínicas y recomendaciones para los pacientes en formato digital.
Para aprender sobre búsqueda bibliográfica utilizaremos MEDLINE por que es de uso gratuito y es una de las bases de datos más completas y complejas; pero no olvide las otras posibilidades citadas en el próximo punto.

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OTRAS BASES DE DATOS EN INTERNET

Las bases de datos de la lista se hallan disponibles desde internet. La National Library of Medicine (NLM) le permite acceder bajo la misma tecnología como lo es el motor de búsqueda de Internet Grateful Med a muchas de estas bases de datos.

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MEDLINE

Es una base de datos que contiene información a modo de índice de referencias o citas bibliográficas de más de 4000 publicaciones periódicas ("journals") biomédicas desde 1966 a la actualidad. Se actualiza semanalmente y cubre los campos de medicina, nutrición, veterinaria, enfermería, farmacología, odontología, salud y ciencias básicas. El 80% de las citas están publicadas en inglés y continenen el abstract.
En 1879 JOHN SHAW BILIINGS quien estaba a cargo de la dirección de la National Library of Medicine (NLM) de los Estados Unidos creo una publicación mensual llamada Index Medicus. Estaba construida con un formato tipo índice de un libro, permitiendo realizar búsquedas de citas bibliográficas a través de temas o autores.
Luego con la aparición de la sistematización de la información en los años 60 se crea MEDLARS (Medical Literature Analysis and Retrieval System), que facilitaba la realización de la búsqueda de datos en las bases de literatura biomédica, que hasta entonces era manual y en 1989 comenzó a comercializarse el MEDLINE que proviene de Medlars On Line. El MEDLINE se halla disponible en CD-ROM, en DVD u online a través de internet (desde 1997) y es el equivalente al Index Medicus.

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USOS

Su utilidad no es sólo para los médicos sino para todo el personal de salud y de investigación biomédica. A través de MEDLINE se puede acceder a búsquedas bibliográficas sobre temas que nos interesan ya sea por un planteo clínico o de investigación biomédica. También se pueden leer los resúmenes de una publicación periódica que no recibe en su lugar de trabajo pero que MEDLINE indexa en su base de datos.
Cada vez más los pacientes están realizando búsquedas de MEDLINE, principalmente en el afán de encontrar tratamientos nuevos, enfrentándonos a los médicos con la necesidad de estar actualizados. Debemos recalcarle a los pacientes que este tipo de búsquedas carece de un analisis adecuado y que tal vez muchos de los resultados de las citas aún no estén validados clínicamente o estén en fase experimental.

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ACCESO

Puede acceder acercándose a una biblioteca que preste servicio de búsqueda bibliográfica. Generalmente el bibliotecario le ofrece el servicio de realizar la búsqueda a partir de las claves que usted le indique y tiene un costo fijo por búsqueda.
Desde el 26 de junio de 1997 la NLM le ofrece la posibilidad de realizar gratuitamente las búsquedas usted mismo o solicitar por correo electrónico que sus bibliotecarios la realicen y el resultado sea enviado a su casilla de correo electrónico. La NLM le ofrece dos motores de búsqueda diferentes:

Otras empresas que ofrecen la posibilidad de realizar búsquedas gratuitas en MEDLINE son:

Debe tener en cuenta que la NLM actualiza el MEDLINE semanalmente y le ofrece el PREMEDLINE con las futuras citas. Las otras empresas o aquellos lugares que lo reciben en CD-ROM o DVD lo actualizan mensual o trimestralmente.

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COMO BUSCAR

Primero daré un detalle general que se aplica a casi todos los buscadores de MEDLINE y otras bases de datos.

Usted podrá realizar las búsquedas a partir de texto libre, para lo cual colocará el término a buscar dentro de los casilleros en blanco del buscador. El resultado es menos específico que utilizando el método de búsqueda a partir de términos MESH, para lo cual deberá buscar el término MESH más adecuado para colocar en los casilleros en blanco, obteniendo un resultado  más específico.

Las palabras a colocar en los campos de búsqueda deben ser escritas en inglés preferentemente.
Su secuencia de escritura de izquierda a derecha es la secuencia de órdenes que realiza el buscador por eso es importante el orden en el que usted las escriba. Esto significa que el término más importante a explorar debe ir más a la izquierda y luego encadenar las órdenes que lo limiten.
Se puede usar un comodín (*) para truncar las palabras, así la búsqueda la realizará sobre las palabras que comiencen con dicha raíz. Esta estrategia trae las primeras 150 variantes y no se puede utilizar con frases. Por ejemplo: Si coloco la palabra: entero* traerá: entero, enterococccus, enterococo, enterotoxina, etc.
Si quiero obligar al buscador a buscar una frase tendré que usar comillas (" ") para encerrarla, de lo contrario por cada espacio en blanco que separe las palabras de la frase interpretará un "AND". Por ejemplo: "cerebrovascular accident"
Las búsquedas a partir de los apellidos de las personas se truncarán automáticamente al finalizar el apellido aunque usted escriba las iniciales del nombre (smith jd). Si coloca comillas entonces lo interpretará como una frase ("smith jd").

Para obtener un mejor resultado en la búsqueda conviene revisar los términos que emplearemos en el Tesauro o MESH Browser: que es un vocabulario de más de 18.000 términos biomédicos (Medical Subject Headings) oragnizado por los indexadores de la NLM para uniformar y dar consistencia al indexar las citas. Los términos están organizados en una estructura jerárquica con forma de arbol, por lo tanto podemos tomar un término madre como raíz y luego subencabezados (Subheadings) que lo califiquen. El vocabulario MESH es revisado anualmente. Las personas encargadas de indexar las citas eligen entre 5 y 15 términos MESH por cada artículo. Podemos de esta manera expandir o focalizar nuestra búsqueda. Habitualmente los buscadores de MEDLINE hacen la búsqueda por defecto en forma expandida por lo tanto incluyen los subheadings. El MESH también incluye los grupos etáreos. Para saber más sobre los términos MESH.

Cuando uno realiza una búsqueda desea que esta sea más sensible o más específica, en cuanto al número y calidad de citas que traiga, según el interés con el que uno la realiza. Por ejemplo:

• si necesito dar respuesta a un paciente sobre un tratamiento la búsqueda debe ser específica y actualizada, para reducir el número de citas al mínimo indispensable que haga factible su lectura en el tiempo apropiado
• si la búsqueda es mi primer paso para comenzar una investigación tendrá que ser más sensible que específica, de esa manera juntar un número de citas importante que me permita una visión global del tema y favorezca la generación de nuevas hipótesis.
• si busco sobre un tema infrecuente deberá ser más sensible que específica, para poder traer la mayor cantidad de artículos posibles, dado que probablemente el número de citas indexadas sea bajo

Una forma sencilla de jugar con la sensibilidad y especificidad de la búsqueda es usar los operadores lógicos o booleanos término con el que son conocidas las conjunciones "AND", "OR" y "NOT". Un simple ejemplo de conjuntos nos permite entender su funcionamiento (el resultado de nuestras búsquedas está representado por el área de color celeste):

	Al usar "AND" el resultado de nuestra búsqueda es más específico que si usaramos solo la palabra asma. Con esta estrategia traerá aquellas citas sobre asma de que contengan la palabra tratamiento, reduciendo así el número de citas para leer.
	Al usar "OR" estamos tratando de ampliar nuestra búsqueda escribiendo sinónimos de nuestra palabra clave o abreviaturas. Así obtendremos una búsqueda más sensible o sea con mayor número de citas. Es útil también cuando nuestro primer intento de búsqueda trae pocas citas.
	Al usar "NOT" estmos excluyendo un grupo de citas del grupo general en el cual estamos buscando. Reducimos el número de citas y hacemos más específica nuestra búsqueda.

Otra forma de hacer más específica la búsqueda es usar los filtros de límites que brindan los distintos buscadores, algunos más eficaces o con mayor número de opciones que otros. Dentro de los límites encontramos:

Por último la forma más avanzada de realizar una búsqueda booleana incluye el conocimiento del nombre o etiqueta de los campos de búsqueda, de esta manera uno puede ser más detallado en cuanto a la exploración o búsqueda de cada término en cada campo de la base de datos. Las abreviaturas de las etiquetas que es lo que nosotros escribiremos se corresponden habitualmente con las iniciales o primeras letras del nombre de las etiquetas de los campos. En la siguiente tabla encontrará una lista de estas etiquetas.

Resumiendo las etiqueta utilizadas con más frecuencia son: [all] [au] [la] [ta] [majr] [mh] [pt] [sh] [ti] [tw]

En una búsqueda booleana avanzada los nombres o etiquetas de los campos deben colocarse entre corchetes y separados por un espacio en blanco después de la palabra clave que colocamos (usaré negritas en el texto solo con fines descriptivos):

• pneumonia [mh] AND mortality [tw]
  Aquí buscará neumonía como término mesh (lo expandirá automáticamente) y mortalidad dentro de las palabras del texto.
• pneumonia [mh] AND mortality [sh:noexp]
  Aquí buscará neumonía como término mesh (lo expandirá automáticamente) y mortalidad como subencabezados pero tiene inhibida la autoexpansión.
• penumonia [majr] AND english [la] AND 1995 [dp]
  Aquí buscará los artículos en los que neumonía sea el tópico principal y el idioma vernáculo del artículo sea inglés en el año 1995. Si hubiera colocado...AND 1995:1999 [dp] buscaría entre los años 1995 y 1999. Las opciones para colocar fechas son los siguientes formatos: aaaa/mm/dd ó aaaa/mm ó aaaa , donde cada letra corresponde a un dígito.

Terminada la búsqueda, las citas apareceran en una nueva página en número de 20 citas por página, desde la cual podremos optar por bajar la o las citas seleccionadas, con o sin abstract, con o sin los términos MESH. En el caso de bajar la cita con los términos MESH éstos aparecerán debajo del abstract y los subencabezados tendrán un * a su derecha.

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MEDLINE POR E-mail

Para la búsqueda por E-mail el mensaje debe tener la dirección query@ncbi.nlm.nih.gov y el Asunto o Tema del mensaje debe estar en blanco. Este mecanismo es útil para realizar búsquedas cuando no tenemos internet o cuando no tenemos tiempo, solo hay que familiarizarse con las siguientes instrucciones.
La sintaxis debe seguir el siguiente orden (se colocó en negritas aquello que forma parte del mensaje pero no es necesario que usted envíe el mensaje en negritas):

DB ..............
TERM ................
DOPT ................
DISPMAX o HTML o PATH .........

DB Corresponde a la base de datos donde queremos realizar la búsqueda MEDLINE o dentro del GENBANK:

"m" MEDLINE
"n" nucleótidos
"p" proteínas
"s" nucleótido o proteína
"t" estructuras 3D

TERM Corresponde a los téminos a buscar. Debemos colocarlos en inglés, podemos usar los operadores lógicos colocándolos en mayúsculas (AND, OR, NOT) y si queremos colocar entre corchetes campos específicos de búsqueda para cada término (abstract, título, autor, etc.). Sino se especifica un campo la búqueda se realiza en todos en forma automática.

DOPT Permite elegir en formato de presentación de los resultados:

"a" ASN.1 format (formato usado para programadores de software)
"b" Abstract format (cita,tútulo, resumen)
"d" Entrez document summary format (muestra solo el título)
"l" MEDLINE format (muestra todos los campos precedidos de la sigla indicadora de campo, por lo tanto nos prermite su importación a otras bases de datos de usos personal como los programas de manejo de referencias bibliográficas)
"m" Muestra artículos relacionados con una cita específica.
"q" Cantidad de citas encontradas
"r" Standard report format (cita, título, resumen, términos de indexación)
"u" PubMed Unique Identifiers (número de identificación de las citas)

En la última línea elegiremos lo que nos convenga:

DISPMAX especifica el número de citas que queremos que nos envíen (por defecto el número es 200)
HTML para recibirlo en formato WEB
PATH para que nos envíen la búsqueda a otro correo electrónico

Veamos dos ejemplos:

DB m
TERM pneumonia
DOPT r
DISPMAX 100
Buscará en neumonía en MEDLINE y enviará las primeras 100 citas en formato standard.

DB m
TERM (pneumonia[tit] AND sepsis[tit] AND smith[au])
DOPT b
PATH adrian@fmed2.uncu.edu.ar
Buscará neumonía y sepsis en el título y que sean del autor Smith, lo enviará en formato de resumen al e-mail que le escribimos.

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ESTRATEGIA DE BÚSQUEDA

Tal vez esto sea lo más difícil de aprender pero uno debe tomarlo como un juego de inteligencia utilizando las herramientas presentadas previamente.
MEDLINE es una de las bases de datos sobre citas bibliográficas más completa y compleja, por lo tanto muchas veces puede ser más fácil encontrar un resultado más acotado y específico recurriendo a una base de datos más pequeña y específica al tema.

1. Defina claramente el interrogante antes de conectar su computadora a internet para evitar mayores costos en la búsqueda. Si su búsqueda está orientada a algunos aspectos clínicos como los de los filtros metodológicos que ofrece Clinical Queries (PubMed), tal vez le convenga comenzar su búqueda desde esta interfase. Si busca una cita en particular utilice el Juornal Browser (PubMed).
2. Si es posible busque los términos correctos para realizar la búsqueda a través de diccionarios médicos, artículos o libros. Otra posibilidad es explorar los términos en el MESH Browser (PubMed o IGM). Si su término no está dentro de los MESH piense en un sinónimo seguramente hallará uno en la vecindad alfabética de la lista ofrecida por el Browser. Eventualmente encontrará una palabra madre más general que tal vez englobe un subencabezado más preciso. En caso de no tener clara la ortografía recuerde la opción que le ofrece PubMed en la búsqueda avanzada llamada "List Terms".
3. Una vez encontrado el o los términos MESH, haciendo clic sobre él aparecerán los "Subheadings" y la opción de poder jerarquizar el término MESH como MAJOR TOPIC que sería el tópico principal que trata el artículo.
4. Comience la búsqueda combinando los términos a través de los operadores lógicos (AND, OR, NOT).
5. Si obtuvo pocas citas y no le satisface agregue más sinónimos a través del OR para ampliar su búsqueda o use un término MESH más general. También puede ampliar su número de citas explorando los artículos relacionados "Related Articles" de alguna cita que le parezca importante. Si la realiza en el IGM puede presionar "Details of sarch" para obsevar a que altura de la búsqueda se reduce significativamente el número de citas.
   Si obtuvo demasiadas citas, aplique límites de campos que ya estén estipulados en el buscador de MEDLINE que haya escogido. Utilice las etiquetas de campo que vimos arriba para especificar más aún la búsqueda, agregue más términos usando operadores lógicos como AND o NOT. También podrá limitar su búsqueda a artículos con absract únicamente o la opción de realizar la búqueda en un subset de revistas como por ej: AIM (Abriged Index Medicus).
6. Si su búsqueda tiene un interés clínico o crítico podrá introducir filtros metodológicos como los que usa el Clinical Queries o podría empezar su búsqueda en éste que ya tiene las estrategias planteadas como filtros con un simple click y evitar escribir las siguientes estrategias.

7. Una vez de acuerdo con el número de citas lo conveniente es bajarlas al disco rígido o diskette en un formato que contenga los abstracts para leerlas o imprimirlas luego de desconectarnos de internet. Recuerde revisar bien las citas porque pueden tener dirección electrónica de algunos artículos o el e-mail de sus autores para solicitarles una copia. Sino existen servicios (algunos mencionados anteriormente) que realizan la búsqueda y entrega de artículos completos a un costo fijo que oscila entre los 10 y 20 dólares.

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BIBLIOGRAFÍA

1. Hshies RCJ. Bases de Datos y Literatura Biomédica. En: Internet Telemática y Salud Olivieri N, Sosa Iudicissa M, Gamboa C. Buenos Aires: Editorial Médica Panamericana; 1997, p. 271-280.
2. Sackett DL, Haynes RB, Guyatt GH, Tugwell P. Búsqueda de Evidencia para solucionar problemas clínicos En: Epidemiología clínica: Ciencia básica para la medicina clínica (2 Edición). Buenos Aires: Editorial Médica Panamericana; 1994, p. 337-349
3. Sackett DL, Richardson WS, Rosemberg W, Haynes RB. Searching for the best evidence In: Evidence-Based Medicine: How to Practice & Teach EBM. New York Eds: Churchill Livingstone; 1997, p. 37-78.
4. Haynes RB, Wilczinski N, McKibbon KA, Walker CJ, Sinclair JC. Developing optimal search strategies for detecting clinincally sound studies in MEDLINE. J Am Med Inform Assoc 1994; 1: 447-58.
5. Haynes RB, Walker CJ, McKibbon KA, Johnston ME, Willian AR. Performancce of 27 MEDLINE system tested by searches on clinical questions. J Am Med Inform Assoc 1994; 1: 285-95.
6. Información publicada para los usuarios en los sitios de IGM y PubMed.

Mendoza, 22 de agosto de 2000

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